home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Danny Amor's Online Library / Danny Amor's Online Library - Volume 1.iso / bbs / misc / prosite.lha / DATA / PDOC00760 < prev    next >
Text File  |  1995-07-26  |  2KB  |  45 lines
  1. ****************************************************
  2. * Clathrin adaptor complexes small chain signature *
  3. ****************************************************
  4.  
  5. Clathrin coated  vesicles (CCV) mediate intracellular membrane traffic such as
  6. receptor mediated  endocytosis.  In addition to clathrin, the CCV are composed
  7. of a number of other components including oligomeric complexes which are known
  8. as adaptor  or  clathrin  assembly  proteins  (AP)  complexes [1]. The adaptor
  9. complexes are  believed  to  interact  with  the cytoplasmic tails of membrane
  10. proteins, leading to their selection and concentration. In mammals two type of
  11. adaptor complexes  are  known: AP-1 which is associated with the Golgi complex
  12. and AP-2  which is associated with the plasma membrane. Both AP-1 and AP-2 are
  13. heterotetramers that  consist  of two large chains - the adaptins - (gamma and
  14. beta' in  AP-1; alpha and beta in AP-2); a medium chain (AP47 in AP-1; AP50 in
  15. AP-2) and a small chain (AP19 in AP-1; AP17 in AP-2).
  16.  
  17. The small  chains  of AP-1 and AP-2 are evolutionary related proteins of about
  18. 18 Kd.   Homologs  of AP17 and AP19 have also been found in yeast (genes APS1/
  19. YAP19 and  APS2/YAP17)  [2,3,4].   AP17 and AP19 are also related to the zeta-
  20. chain [5] of coatomer (zeta-cop),  a cytosolic protein complex that reversibly
  21. associates with Golgi  membranes  to  form vesicles that  mediate biosynthetic
  22. protein transport  from    the  endoplasmic reticulum, via the Golgi up to the
  23. trans Golgi network.
  24.  
  25. As a  signature pattern, we selected a conserved region in the central section
  26. of these proteins.
  27.  
  28. -Consensus pattern: [LIVM](2)-Y-[KR]-x(4)-L-Y-F
  29. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  30. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  31. -Last update: June 1994 / First entry.
  32.  
  33. [ 1] Pearse B.M., Robinson M.S.
  34.      Ann. Rev. Cell Biol. 6:151-171(1990).
  35. [ 2] Kirchhausen T., Davis A.C., Frucht S., O'Brine Greco B., Payne G.S.,
  36.      Tubb B.
  37.      J. Biol. Chem. 266:11153-11157(1991).
  38. [ 3] Nakai M., Takada T., Endo T.
  39.      Biochim. Biophys. Acta 1174:282-284(1993).
  40. [ 4] Phan H.L., Finlay J.A., Chu D.S., Tan P.K., Kirchhausen T., Payne G.S.
  41.      EMBO J. 13:1706-1717(1994).
  42. [ 5] Kuge O., Hara-Kuge S., Orci L., Ravazzola M., Amherdt M., Tanigawa G.,
  43.      Wieland F.T., Rothman J.E.
  44.      J. Cell Biol. 123:1727-1734(1993).
  45.